Ĉi tiu retejo uzas kuketojn por ke ni povu provizi al vi la plej bonan sperton de ebla uzanto. Kuket-informoj konserviĝas en via retumilo kaj plenumas funkciojn kiel rekoni vin, kiam vi revenos al nia retejo kaj helpas nian teamon kompreni, kiujn sekcioj de la retejo vi plej interesas kaj utilas.
Simpligita genetika testado por ĉiuj EB-tipoj
Pli malmultekosta, pli rapida metodo por sekvenci EB-genojn povus signifi pli fruan diagnozon, donante al familioj pli grandan komprenon pri malsanefiko kaj aliron al taŭga subteno.
D-ro Ene-Choo Tan laboras en hospitalo en Singapuro kie 12-15 homoj kun EB-simptomoj, post konsento pri genetika testado, donos malgrandan sangospecimon. Ĉi tiu projekto sekvos genojn konatajn esti implikitaj en EB uzante malsamajn metodojn por identigi kaj plibonigi la plej bonan manieron rapide akiri precizajn rezultojn.
Legu pli en la blogo de nia esploristo.
Bildkredito: Nacia Homa Genoma Esplorinstituto (NHGRI).
Pri nia financado
Esplorgvidanto | D-ro Ene-Choo Tan |
institucio | KK Women's & Infanhospitalo, Singapuro |
Specoj de EB | Ĉiuj specoj de EB |
Partopreno de paciento | 12-15 homoj estu genetike testitaj pri EB |
Sumo de financado | £10,500 |
Longo de la projekto | 1 jaro |
Komenca dato | 1 marto 2024 |
DEBRA interna ID | GR000044 |
Projektaj detaloj
Esploristoj vojaĝis al malsamaj sudorientaziaj landoj por labori kun lokaj kuracistoj pri la diagnozo kaj administrado de EB-pacientoj. Ili uzas pli novan, longlegan sekvencteknologion por malkovri genetikajn ŝanĝojn, kiuj estas sopiritaj de la pli malnova, mallonglega sekvencteknologio.
Ĉefesploristo: D-ro Tan estas trejnita kiel molekula genetikulo, kun magistro de la Universitato de Viskonsino - Madison kaj PhD de la Instituto de Molekula kaj Ĉela Biologio.
Kunesploristo: D-ro Koh estas pediatria dermatologo kun speciala intereso pri genetikaj haŭtaj malordoj, inkluzive de EB. Li helpis starigi DEBRA Singapuron kaj ofte kunlaboras kun aliaj pediatriaj dermatologoj de ĉirkaŭ la regiono por administri pacientojn kun EB.
"Kvankam iuj kazoj povas esti klinike diagnozitaj, la interkovraj kaj aĝ-rilataj prezentoj igas ĝin malfacila fari precizan diagnozon de la specifa tipo. Ricevi genetikan diagnozon en EB ebligos la precizan diagnozon de la specifa subtipo, kiu estas grava por longperspektiva prognozo kaj taŭga administrado de simptomoj... La identigo de genetika mutacio ankaŭ estas grava por antaŭnaska testado en severaj kazoj kaj familiara testado de biologia. parencoj, kaj gvidas decidojn pri familiplanado."
– Doktoro Tan
Subvenciotitolo: Plibonigante la genetikan diagnozon de epidermolysis bullosa per longlega sekvencado.
Epidermolysis Bullosa (EB) estas malofta kondiĉo karakterizita per haŭta malfortikeco, kondukante al veziketoj kaj erozioj sur negrava traŭmato. En certaj specoj de EB, cikatriĝo povas okazi sekundara al la veziketoj kaj erozioj. Krom la haŭto, EB ankaŭ povas influi mukozajn surfacojn kovritajn per epitelio, kiel ekzemple la buŝo, ezofago, gastro-intesta vojo, urinkanalo kaj okuloj. Cikatriĝo en ĉi tiuj histoj povas okazi, kondukante al pliaj komplikaĵoj kiel striktigoj. EB ankaŭ povas konduki al aliaj komplikaĵoj kiel anemio, malbona kresko kaj ortopediaj problemoj, same kiel pliigita risko por certaj specoj de haŭtaj kanceroj, kiel skvamĉela karcinomo. Ĉiuj kvar ĉefaj specoj de EB (EB-simplekso, kunjunkcia EB, distrofa EB kaj Kindler-sindromo) estas kaŭzitaj de genetikaj anomalioj.
Ĉar EB estas klinike heterogena kun spektro de severeco kaj imbrikitaj prezentoj, povas esti malfacile distingi inter la ĉefaj tipoj, same kiel la pli ol 30 klinikaj subtipoj, precipe dum la fruaj jaroj de vivo. Molekula konfirmo devas esti farita por definitiva diagnozo por helpi antaŭdiri longdaŭran rezulton kaj gvidi taŭgan traktadon. Sukcesprocento en akirado de pozitiva rezulto per genetika testado varias de 50-90% por la nunaj metodoj de unugena Sanger aŭ plurgena mallonglega sekvencado. Long-lega sekvencado ne estis uzita grandskale por esplori multoblajn EB-genojn. La Nanopore longlega teknologio povas sekvenci longajn fragmentojn de DNA por permesi pli kompletan sekvencon de la tuta geno povas rezultigi pli bonan rendimenton malkovri subestajn genetikajn mutaciojn, disponigante pli precizan diagnozon.
La klinikaj trajtoj de la diversaj specoj de EB povas interkovri kaj ofte prezenti diagnozan dilemon en frua vivo. Frua kaj preciza genetika testado povas konduki al rapida diagnozo de la EB-subtipo, disponigante pli bonan prognozon kaj plibonigitan administradon same kiel por antaŭvidi kaj monitori por komplikaĵoj.
Nuntempe, genetika testado estas per samtempa sekvencado de multoblaj genoj aŭ la ekzomo (gen-enhavantaj regionoj de la genaro), kiu tipe sekvencas mallongajn fragmentojn. Nanoporsekvencado de pli longaj fragmentoj (inkluzive de ne-kodaj regionoj) eble povas rezultigi pli altan diagnozan rendimenton kaj malkovri pli genetikajn variaĵojn. Akiri pozitivan genetikan rezulton gravas por pacientoj. En severaj pediatriaj kazoj, estas grave havi fermon por gepatroj kaj helpi en estonta gravedeco. Identigi la genetikan variaĵon en probando ankaŭ permesas la taksadon de risko por la grandfamilio. Informoj pri la genetika difekto ankaŭ povas esti utiligitaj por portantotestado por recesivaj formoj de EB kie la du misaj aleloj estas hereditaj de ambaŭ gepatroj kiuj ĉiu portas difektitan kopion. Genetika testado ankaŭ povas esti farita por identigi spontaneajn mutaciojn por dominaj formoj de EB por antaŭnaska aŭ antaŭ-implantada testado.
Por pli bone kompreni la klinikan malsankurson subestantajn EB-simptomojn, ni bezonus pli da genetikaj variantoj por esti identigitaj en multoblaj pacientoj por pli bone korelacii la genetikajn datumojn kun malsanprezentoj. Malkovri pli da genetikaj variaĵoj ankaŭ kondukus al pli bona kompreno de la molekulaj procezoj dum malsanpatogenezo, kiu povas konduki al la evoluo de novaj farmakologiaj agentoj kaj aliaj traktadoj.
Mi estas genetikulo kun intereso malkovri la bazon de malsanoj kun genetika kaŭzo. Mia kunenketisto estas dermatologo kun speciala intereso pri EB. Li aktivis en la loka EB-komunumo kaj ankaŭ en la regiono, vojaĝante al aliaj sudorient-aziaj landoj por labori kun la lokaj kuracistoj pri la diagnozo kaj administrado de EB-pacientoj. Ni uzis genetikan sekvencon por identigi la molekulajn anomaliojn de genetikaj malordoj. Venontgeneracia sekvencado uzanta la mallonglega teknologio (kiel ekzemple la Illumina kaj Ion-platformoj) nun estas establita kaj fariĝis normo de prizorgo en klinika praktiko sed havas limigojn en la vico da genetikaj anomalioj kiujn ĝi povas identigi. Ni laboras pri la pli nova longlega sekvencada teknologio por espereble malkovri genetikajn anomaliojn, kiuj estas maltrafitaj de la mallonglega sekvencado, kiuj inkluzivas pli grandajn forigojn, enmetojn kaj duobligojn.